员工差旅费报销发票金额为2000元，但按照公司报销标准只能报销1200元。那么超过报销标准的800元进项税该怎么办呢？

超出公司报销标准的部分由员工承担，即超出部分800元作为员工个人消费部分。

根据规定，进项税不能由公司扣除，需要转出。

因此，公司在办理超出报销标准的专用发票时，应先核对认证扣款，再将超出部分作为进项转出办理。

参考法律法规:《增值税暂行条例》第十条，个人消费购买的货物、劳务、无形资产和不动产，进项税额不得从销项税额中扣除。

附件:差旅费报销会计分录。

1.如果公司没有贷款，涉及的会计分录如下:

借:行政费用-差旅费。

信用:库存现金。

二、公司预借差旅费，做如下分录:

1.提前借款时:

借款:其他应收款-员工。

信用:库存现金。

2.报销时:

(1)全部花完。

借:行政费用-差旅费。

贷方:其他应收款-员工。

(2)有剩余现金。

借:手头现金。

行政费用-差旅费。

贷方:其他应收款-员工。

(3)在补缴时。

借:行政费用-差旅费。

信用:库存现金。

其他应收款-员工。