日本申请商标注册分为三个阶段，即申请阶段、审查阶段和注册阶段。参考以下流程图，简单介绍这三个阶段的基础知识、所需信息或成本。异议、无效、撤销、行政诉讼等程序的内容暂不涉及。
申请阶段
在申请阶段，申请人首先需要指定申请商标的图案或文字，以及指定的类别和商品和/或服务。然后，我们需要选择合适的专利商标局。委托日本专利商标局时，通常会向对方提供以下信息。
申请阶段信息列表：
1)申请人姓名及地址(中文或英文)
2)指定类别及商品/服务
3)商标图案(如商标为无设计的纯文字，无需说明，仅用文字表述)
4)优先权文件(如有)(优先权文件可自申请日起三个月内补充)
在申请阶段，一般来说，
申请提交后，日本专利局会先给出申请号并公开申请。对文件中的缺陷进行正式审查后，将进入实质性审查阶段。
日本专利局受理一标多品类申请，申请阶段官方收费第一品类日元，第二品类每品类8600日元。
检查阶段
根据检查结果发出拒绝或批准注册的通知。
如果申请人收到驳回通知后未予回复，日本专利局将发布驳回决定。申请人也可以选择回复拒绝通知，并提交意见和/或更正。日本审查员收到申请人提交的意见和/或更正后，继续审查或直接做出驳回决定。如果收到驳回决定，申请人也可以选择继续提交复审请求。
如上所述，日本专利局接受一个标准和多个类别的申请，并且对指定商品/服务的数量没有限制。但需要注意的是，如果指定商品/服务的范围太广，审查员很容易质疑该商标是否会被实际使用或计划使用，然后发出拒绝通知。
如果没有拒绝通知，从申请到收到注册批准通知大约需要6到8个月。
注册阶段
申请人收到注册核准通知书后，需要在收到核准通知书之日起30日内缴纳注册费。申请人缴纳费用后将被注册，日本专利局将发布商标公告。除了一次性支付10年的费用外，在商业前景不明显的情况下，申请人可以选择只支付5年的费用。
注册费明细
1)10年保护期官方费用为日元/类
2)5年保护期官方费用为日元/类
基本上在缴纳注册费后一个月内会出具注册证明。
注册后一个月内，日本专利局会发布商标公告。自发布之日起2个月内，任何人都可以提出异议申请。