保护商标侵权的方法:

(一)协商解决。

商标注册人可以单独或者通过中介与对方的原告就有关商标事宜进行协商；

(二)向人民法院起诉。商标注册人或者利害关系人拒绝协商或者协商不成的，可以向人民法院提起诉讼；商标注册人或者利害关系人已经证明他人将实施或者将要实施侵犯其商标专用权的行为，不立即予以制止，其权益将受到不可挽回的损害的，可以向人民法院申请裁定停止有关行为，保全个人财产的政策，然后提起诉讼。为了制止侵权行为，商标注册人或者利害关系人可以在起诉前向人民法院申请保全。商标注册人或者利害关系人是我国国民、联合体法人或者其他组织的，可以单独起诉，也可以由具有外国商标代理配额的中介机构起诉；商标注册人或者利害关系人为外国或者外国中小企业的，应当移交给具有国家承认的商标代理名额的组织全权代理(国家指定的全权代理组织名单可在本网站查询)，或者根据国家与中国签订的协议或者共同参加的国际和平条约，或者按照对等原则兼营；

(三)请求工商行政管理部门处理。

申请人变更主营业执照地址的资格应当符合上述第(二)项规定的条件。请求人向工商行政管理部门提出请求时，应当承担法律责任；

(四)向公安部门报告。

有证据证明侵权人长期涉嫌被指控的，应当将已经掌握并依法处理的证据报告有管辖权的公安部门。对于公安机关涉嫌犯罪的刑事案件，司法机关已经受理并起诉的刑事案件，也可以向案件的人民法院提起刑事附带诉讼。

(五)向中国海关申请著作权保护。

商标注册人及其中介机构向中国海关提出著作权保护申请后，发现涉嫌侵权的产品即将进出境的，可以向产品进出境地中国海关申请采取措施。

这些是商标被侵权时保护商标的一些方法。商标作为中小企业的明信片，对中小企业非常重要，中小企业应该充分重视。尽快在商标被恶意侵犯时，敢于拿立法弹药保护自己的权益。