1.与法人协商，以股权转让代替注销。

法人因为想继续经营公司，不愿意配合注销，可以在符合法律和内部管理制度的情况下，将拟注销企业的股权转让给法定代表人。这样就可以免去后续的清算和注销手续，省时省力。

2.作为债权人申请破产。

是破产公司注销的主要条件之一。如果法人不配合，可以作为债权人向法院提出破产申请，然后进入破产清算程序。清算结束后，予以注销。

3.与行政部门沟通解决问题。

要解铃还须系铃人。既然目的是办理工商变更注销登记，可以尝试与行政部门沟通，在符合基本原则的基础上，就具体手续办理中遇到的实际困难寻求帮助。

4.股东大会决定解散。

股东大会只有三分之二的股东才能召开，其中三分之二不是股东人数，而是股份比例。

5.强制取消

对于强制注销程序，无论法人不配合还是无法取得联系，都可以强制注销。

二、公司不及时注销的后果

如果是因为法人股东不配合或者联系不上不注销，可能会产生以下后果：

1.公司营业执照被吊销了，注销比以前麻烦；

2.股东、法人进入工商局黑名单，三年内不能再次办理营业执照；

3.税收罚款与日俱增；

4.影响所有高管的养老金和子女教育；

5.限制旅游和高消费。