公司注册商标申请的程序流程如下：

　　1、商标检索查询

去中国商标网查查有没有类似的商标，确认没有类似的商标，提交商标注册申请。
　　2、形式审查

正式审查期大概会在申请提交后的3-4周内完成。形式审查通过后，商标局出具《商标注册受理通知书》。
　　3、实质审查阶段

表格审核后，进入实质审核阶段，大概需要一年时间。如果通过了实质审查，就进入公告程序，也就是所谓的异议期，持续3个月左右。
　　4、具体审查阶段

经过半年的实质审查，在中国商标网查询商标申请详情。八个月后，如果商标被驳回，我收到《商标驳回通知书》，被告知驳回的详细理由。
　　5、商标公告

两个月后，商标未被驳回，商标局审查完毕，商标局在官网正式公告。5个月后，公告期满，无异议，《商标注册证》，商标注册完成。

这是上述公司申请商标的具体流程。希望对大家分享有帮助。有关商标注册的更多知识，请咨询我行知识产权。