根据《中华人民共和国企业所得税法》第五十条第二款的规定，居民企业在中国境内设立的不具有法人资格的营业机构，应当汇总计算缴纳企业所得税。
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一、跨地区经营合并纳税企业的分支机构
《国家税务总局关于印发的公告》(国家税务总局公告2012年第57号)第二条、第三条规定，在中国境内跨地区(指省、自治区、直辖市和计划单列市)设立居民企业。不具有法人资格的分支机构、居民企业是跨地区经营的合并纳税人。除另有规定外，企业所得税实行“统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算”
(1)统一计算。【/s2/
(2)分级管理。总公司和分公司受当地主管税务机关的管理。因为总机构和分支机构所在地的主管税务机关负责地方机构的企业所得税管理。
(3)预付款到位。【/s2/】根据当地法律法规，总行应按月或按季向当地主管税务机关报告企业所得税预缴情况。
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(4)简易清算。【/s2/】是指年末后，总行对应税企业的年度应纳税所得额和所得税进行计算汇总，将当年总行和分支机构预缴的企业所得税分期冲减，然后多退少补。
(5)资金转移。【/s2/】财政部根据批准的系数，定期调整从缴入中央国库的合并企业所得税向地方国库分配的收入。
根据第十条的规定，征收税款的企业应当在年度终了后五个月内，计算总机构应缴纳的年度所得税，扣除总机构和分支机构已预缴的税款，计算总机构和分支机构应退税款，然后按照本办法规定的分税制计算总机构和分支机构应退税款，由总机构和分支机构当场办理纳税或退税。
综上所述，对于跨地区合并纳税企业，其不具有法人资格的分支机构应按季度和年度办理企业所得税申报表。
二.非跨地区合并纳税企业分支机构
对于总分支机构和办事机构设在同一地区的合并纳税企业，本着方便纳税人纳税、提高征管效率的原则，统一汇总到总行计算缴纳企业所得税，分支机构无需办理季度和年度企业所得税申报表。
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